系谱近交系数计算
输入系谱(每行一个个体:个体, 父, 母,父母未知则留空),自动计算每个个体的近交系数 F 及加性遗传相关矩阵(A 矩阵)。
Pedigree Inbreeding Coefficient Calculator
Compute inbreeding coefficient from pedigree.
示例:S、A、D 为始祖;B=S×A、C=S×D;X=B×C(半同胞交配,预期 F≈12.5%)。父母须排在其后代之前。
💡 Wright 公式:Fx = Σ (1/2)^(n₁+n₂+1) × (1+Fa);其中 n₁、n₂ 为父、母到共同祖先的世代数,Fa 为共同祖先自身近交系数。表列法:Fᵢ = ½ × A(父ᵢ, 母ᵢ)。
📊 加性遗传相关矩阵(A 矩阵)
⚠️ 使用说明与注意事项
- 个体名区分大小写,不能重名;同一行用半角逗号分隔
- 父母须在后代之前出现,否则视为未知(始祖处理)
- 近交系数参考:F<6.25% 可接受,6.25%~12.5% 需注意,>12.5% 近交衰退风险高
- 本工具纯前端运行,数据不会上传到服务器
🕘 最近计算
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📚 深度解析:系谱近交系数计算
💡 常见使用场景
- 由系谱(父/母)用矩阵法或路径法求个体近交系数 F。
- 育种规划避免近交衰退。
- 输出亲缘矩阵与 F 评级。
公畜配其女
sire 同时是 dam 之父:后代 F=0.25(25%),属重度近交。
半同胞交配
共享一个祖代:F=0.125(12.5%),中度近交。
❓ 常见问题(FAQ)
- F 含义?
- F 为个体基因纯合概率,F 越高近交衰退风险越大。
- 阈值?
- 一般 F<6.25%(半叔侄级)可接受,≥12.5% 需警惕。
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工具简介
用于家畜系谱分析。输入个体及其父母信息,采用 Henderson 表列法计算每个个体的近交系数(Wright 路径公式等价),并输出完整的加性遗传相关矩阵(A 矩阵),可用于育种选配与亲缘分析。
功能特点
- 纯前端处理,数据不上传服务器
- Wright 近交系数 + A 矩阵
- 自动拓扑排序与循环检测
- 近交风险等级评价
使用场景
- 种畜选配近交风险评估
- 保种群亲缘关系分析
- 育种值估计数据准备
- 教学演示系谱计算